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用于高通量单细胞RNA测序的惯性有序辅助液滴微
行业新闻 2018-11-29 10:42
  单细胞RNA-seq揭示了细胞群中固有的细胞异质性,这在许多临床和研究应用中非常重要。液滴微流体学的最新进展已经实现了液滴隔室中单细胞的自动分离,裂解和标记,而无需复杂的仪器。然而,细胞包封过程中发生的条形码错误是由于珠子中的多珠和由于低浓度的珠子以避免多个珠子在液滴中而导致的通量不足仍然是精确和有效的表达谱分析的重要挑战单细胞

用于高通量单细胞RNA测序的惯性有序辅助液滴微流体
 
  在这项研究中,三星基因组研究所的研究人员开发了一种新的基于液滴的微流体平台,通过确定性封装惯性有序珠子,显着提高了通量,同时减少了条形码错误。含有寡核苷酸条形码的高度浓缩的珠子通过惯性效应在螺旋通道中自发排序,然后逐个包裹在液滴中,同时将细胞同时包封在液滴中。

      尽管珠子浓度增加到1000μl-1,但珠子的确定性包封导致高比例的单珠子在液滴中并且稀有的多珠子在液滴中,这减少了条形码误差并且使得精确的高 - 吞吐量条形码。研究人员用单细胞RNA-seq成功验证了他们的装置。此外,他们发现了多个珠子在一个小滴,使用具有高浓度珠子的正常Drop-Seq装置,低估的转录物数量和高估的细胞数量产生。这种精确的高通量平台可以扩展Drop-Seq在单细胞分析中的能力和实用性。

  移动通过螺旋渠道的小珠的微观图象。(比例尺表示500μm)


用于高通量单细胞RNA测序的惯性有序辅助液滴微流体


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