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人癌细胞系的全面转录肖像
行业新闻 2019-01-14 11:03

  2016年,10x Genomics公司推出ChromiumTM系统,这是一套分子条形码和分析系统,由仪器、试剂盒和信息学软件组成,能全面对接Illumina测序仪。

  肿瘤来源的细胞系已成为促进我们对癌基因功能和治疗反应的理解的重要模型。尽管已经做出大量努力来确定癌细胞系组的基因组构成,但转录组仍未得到充分研究。

人癌细胞系的全面转录肖像

  Genetech的研究人员描述了675种人类癌细胞系的RNA测序和单核苷酸多态性(SNP)阵列分析。他们报告了转录组特征的综合分析,包括基因表达,突变,基因融合和非人序列的表达。在编目的2,200个基因融合中,1,435个由先前未在融合中发现的基因组成,为进一步研究提供了许多线索。研究人员将多种基因组和转录组特征结合在一种基于通路的方法中,以增强对靶向治疗反应的预测。这些结果为使用癌细胞系的研究提供了宝贵的资源。

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