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中国大sa(Andrias davidianus)的测序和从头转录组装配
行业新闻 2018-12-14 10:54

  用于确定基因组学和转录组学组成的下一代技术具有广泛的应用。Andrias davidianus,已成为中国濒临灭绝的两栖蝾螈物种。但是,缺乏分子信息。

  在这项研究中,来自河南科技大学的研究人员使用Illumina HiSeq 2500平台从A。 davidianus组织中获得了RNA-Seq数据,包括脾脏,肝脏,肌肉,肾脏,皮肤,睾丸,肠道和心脏。共获得15,398,997,600bp,相当于102,659,984个原始读数。在去除低质量读取和修剪适配器序列后,总共102,​​659,984个读取被过滤。

中国大sa(Andrias davidianus)的测序和从头转录组装配

  在三位一体该程序用于从头组装132,912个unigenes,平均长度为690bp,N50为1263bp。Unigenes通过多个数据库进行注释。这些A。 davidianus的转录组学数据应该打开分子进化研究的大门,这些研究基于整个转录组或目标基因序列。

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