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NOAA研究人员构建了第一个白鲸血液转录组
行业新闻 2018-12-12 14:56

  评估海洋哺乳动物哨兵物种的健康状况对于了解环境扰动对海洋生态系统和人类健康的影响至关重要。在北极地区,白鲸(Delphinapterus leucas)是高等级捕食者,可能作为哨兵物种,可能预测对人类健康的影响。虽然血液转录组的基因表达谱已被广泛用于评估人类和兽医的健康状况和环境暴露,但由于缺乏可用的基因组和基线数据,其在野生动物中的应用受到限制。

NOAA研究人员构建了第一个白鲸血液转录组
 

  为此,国家沿海海洋科学中心的研究人员在2012 - 2014年期间,在健康的布里斯托尔湾,AK库存的年度健康评估期间收集的样本中构建了第一个白鲸鲸血液转录组,以建立白鲸血液转录组的含量和变异的基线信息。来自白鲸的Trinity转录组装配由91,325个转录本组成,代表了广泛的细胞功能和过程,其内容与另一种鲸类海豚的血液转录组非常相似。白鲸(25%TPM,每百万转录本)的血红蛋白转录物表达低于许多其他哺乳动物。已鉴定出白鲸的HBB序列中的T12A氨基酸取代,但不是宽吻海豚,并且可能在低温适应中起作用。

  白癜风血液转录组在性别和年份之间极其稳定,通过主成分分析没有明显的样本聚类,<4%的基因差异表达(EBseq,FDR <0。05)。虽然必须建立季节,性成熟,疾病和地理对白鲸血液转录组的影响,但涉及压力,解毒和免疫功能的转录物的存在表明血液基因表达分析可提供有关健康状况和暴露的信息。本研究提供了大量关于白鲸的转录组学数据,并提供了大量初步数据,以便与白鲸的其他研究进行比较。4%的基因差异表达(EBseq,FDR <0。05)。虽然必须建立季节,性成熟,疾病和地理对白鲸血液转录组的影响,但涉及压力,解毒和免疫功能的转录物的存在表明血液基因表达分析可提供有关健康状况和暴露的信息。

NOAA研究人员构建了第一个白鲸血液转录组

  本研究提供了大量关于白鲸的转录组学数据,并提供了大量初步数据,以便与白鲸的其他研究进行比较。4%的基因差异表达(EBseq,FDR <0。05)。虽然必须建立季节,性成熟,疾病和地理对白鲸血液转录组的影响,但涉及压力,解毒和免疫功能的转录物的存在表明血液基因表达分析可提供有关健康状况和暴露的信息。本研究提供了大量关于白鲸的转录组学数据,并提供了大量初步数据,以便与白鲸的其他研究进行比较。和免疫功能表明,血液基因表达分析可以提供有关健康状况和暴露的信息。本研究提供了大量关于白鲸的转录组学数据,并提供了大量初步数据,以便与白鲸的其他研究进行比较。和免疫功能表明,血液基因表达分析可以提供有关健康状况和暴露的信息。

  本研究提供了大量关于白鲸的转录组学数据,并提供了大量初步数据,以便与白鲸的其他研究进行比较。

       文章内容摘自网络。

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